Руководство по работе на вычислительном кластере

Купить бумажную книгу и читать

Название: Руководство по работе на вычислительном кластере. Учебное пособие

Автор: Шпаковский Г. И., Верхотуров А. Е., Серикова Н. В.

Издательство: Минск.: БГУ

Год: 2004

Страниц: 172

Формат: PDF

Размер: 1,9 Мб

Качество: отличное (векторный оригинал-макет)

Язык: русский

В пособии рассматривается организация вычислительного кластера на базе локальной сети. Изложены способы инсталляции системного программного обеспечения, методы запуска параллельных задач, описаны средства оценки эффективности вычислений, представлено описание библиотеки для параллельных вычислений PETSc.

Предназначено студентам специальностей «Радиофизика» и «Физическая электроника». Издание может быть полезно студентам естественнонаучных специальностей и научным работникам для создания вычислительного кластера и изучения работы на нем.

Содержание

ПРЕДИСЛОВИЕ.

I. ОРГАНИЗАЦИЯ КЛАСТЕРОВ.

Глава 1. Сетевые средства кластеров.

1.1. Классы параллельных ЭВМ, кластеры

1.2. Компьютерные сети.

1.3. Сетевые операционные системы.

1.4. Характеристики некоторых компьютерных сетей.

1.5. Кластер СКИФ.

1.6. Метакомпьютинг.

Контрольные вопросы.

Глава 2. Системные программные средства кластеров.

2.1. Системы программирования для кластеров.

2.2. MPICH – основная реализации MPI.

Контрольные вопросы.

Глава 3. Инсталляция и настройка средств кластера.

3.1. Требования к аппаратному обеспечению кластера.

3.2. Инсталляция и настройка элементов кластера

3.3. Тестирование кластера на работоспособность и производительность.

Контрольные вопросы.

II. РАБОТА НА КЛАСТЕРЕ.

Глава 4. Запуск и выполнение приложений на кластере.

4.1. Этапы подготовки и выполнения приложения

4.2. Организация работы пользователя.

4.3. Настройка компилятора для работы с MPICH

4.4. Запуск MPI-программ на одном процессоре

4.5. Запуск приложений в многопроцессорном режиме.

4.6. Пример запуска и выполнения стандартных параллельных

приложений.

Контрольные вопросы.

Глава 5. Отладка параллельных приложений.

5.1. Особенности отладки параллельных приложений.

5.2. Трассировка

5.3. Отладка с помощью последовательных отладчиков.

5.4. Параллельный Отладчик TotalView.

Контрольные вопросы.

Глава 6. Профилирование параллельных приложений

6.1. Профилирование

6.2. Библиотека MPE

6.3. Самопрофилирование

6.4. Форматы логфайлов.

6.5. Использование библиотеки профилирования MPE.

6.6. Визуализация результатов.

6.7. Пример профилирования.

Контрольные вопросы.

Глава 7. Эффективность параллельных вычислений.

7.1. Сетевой закон Амдала.

7.2. Эффективность и масштабируемость вычислений.

7.3. Системные проблемы.

Контрольные вопросы.

III. БИБЛИОТЕКА PETSC.

Глава 8. Начальные сведения.

8.1. Состав библиотеки.

8.2. Запуск PETSc-программ.

8.3. Написание PETSc-программ.

8.4. Пример простой параллельной PETSc-программы.

8.5. Структура корневой директории.

Контрольные вопросы.

Глава 9. Векторы и параллельное распределение данных.

9.1. Создание и сборка векторов.

9.2. Основные векторные операции.

9.3. Индексация и упорядочивание.

9.4. Структуированные сетки, использующие распределенные массивы.

9.5. Программное обеспечение для управления векторами, связанными с неструктуированными сетками.

Глава 10. Матрицы.

10.1. Введение.

10.2. Создание и сборка матриц.

10.3. Основные матричные операции.

10.4. Нематричное представление матриц.

10.5. Другие матричные операции.

Глава 11. SLES: решатели систем линейных уравнений.

11.1. Использование SLES.

11.2. Решение последовательных линейных систем.

11.3. Методы Крылова.

11.4. Переобусловливатели.

ПРИЛОЖЕНИЕ.

Некоторые термины раздела 3.

Указатель функций раздала 3.

ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ.

ЛИТЕРАТУРА.